EURES ima osobito važnu ulogu u prekograničnim regijama - područjima gdje postoji značajan stupanj prekograničnih dnevnih migracija.
Više od 600.000 osoba koje žive u jednoj državi EU i rade u drugoj susreću se sa različitim nacionalnim praksama i pravnim sustavima, te na dnevnoj bazi nailaze na administrativne, pravne ili porezne prepreke mobilnosti.

EURES savjetnici u tim regijama pružaju specifične savjete i smjernice o pravima i obvezama radnika koji žive u jednoj zemlji, a rade u drugoj.
Trenutno postoji više od 20 EURES prekograničnih partnerstava, geografski rasprostranjenih širom Europe na području 13 država. S ciljem zadovoljavanja potreba za informacijama i koordinacijom te povezano sa mobilnošću radne snage u graničnim regijama, ova partnerstva spajaju usluge javnih zavoda i profesionalnog usmjeravanja, organizacije poslodavaca i sindikata, lokalne vlasti i ostale institucije koje se bave zapošljavanjem i profesionalnim usmjeravanjem.

EURES prekogranična partnerstva dragocjene su točke kontakata između nositelja politika zapošljavanja - kako na regionalnom tako i nacionalnom nivou – i socijalnim partnerima. Također, važan su alat monitoringa prekograničnih područja zapošljavanja, koji su ključni element u razvoju autentičnog europskog tržišta rada.